1993 yılında İzmir'de hapisde bir öğrenci ölür. Otopsi sonucuna göre ölüm nedeni veremdir. Sağlık merkezinin ise öğrencinin işkence sebebiyle ölmüş olabileceğine dair şüpheleri vardır. İnsan Hakları Komisyonu tarafından yayınlanan Minnesota Protokolü'ne göre işkence şüphesi bulunan durumlarda tıbbi olarak kanıtlanmış işkence izleri mahkemeye delil olarak sunulabilir. Bu olay üstüne Türkiye'deki doktorlar ve avukatlar biraraya gelirler ve kendi protokollerini oluşturmak üzere çalışmalara başlarlar. "Scintigraphie" adlı işkence izlerini yıllar sonra bile ortaya çıkarabilen metod geliştirirler. Böylece 1996 - 1999 yılları arasında İstanbul Protokolü oluşur. Film bu konuda cesur girişimlerde bulunan ve aktif olarak çalışan insanların devlet, toplum ve aile içinde tolere edilen şiddet konusundaki görüşlerini ortaya koyuyor. Polemiklerden uzak bir belgesel film.